Transcriptome mining of immune-related genes in the muricid snail Concholepas concholepas.
Concholepas concholepas
Détrée, C, Gallardo-Escárate, C., Lafarga-De la Cruz, F, López-Landavery, E
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1050464817305806?casa_token=mQd2BTKTya4AAAAA:awcSXmWvX0Hi8XH5Sxz3bqpwcNzCT8oburneBuMCd605VzmVgG_vN6wLeCvs6-C51qdCA11xSA
La población del gasterópodo marino endémico chileno Concholepas concholepas, llamado localmente “loco”, ha disminuido dramáticamente en los últimos 50 años como resultado de la intensa actividad de las pesquerías locales y la alta variabilidad ambiental observada a lo largo de la costa chilena, incluidos episodios de hipoxia, cambios en el nivel del mar. temperatura de la superficie, acidificación de los océanos y enfermedades. En este estudio, nos propusimos explorar las bases moleculares de C. concholepas para hacer frente a factores estresantes bióticos como la exposición a la bacteria patógena Vibrio anguillarum. Aquí se realizaron 454 pirosecuenciaciones y se identificaron 61 transcripciones relacionadas con la respuesta inmune en esta especie de murícido. Entre estos, se evaluó la expresión de seis genes (CcNFκβ, CcIκβ, CcLITAF, CcTLR, CcCas8 y CcCath) involucrados en la regulación de procesos inflamatorios, apoptóticos e inmunes ante estímulos, durante las primeras 33 h posteriores al desafío (hpc). Los resultados mostraron que CcTLR, CcCas8 y CcCath tienen una respuesta inicial a los 4 hpc, evidenciando una regulación positiva de 4 a 24 hpc. En particular, la respuesta de CcNFKB se produjo 2 h después con una regulación positiva estadísticamente significativa a 6 hpc y 10 hpc. Además, el desafío con V. anguillarum indujo una regulación negativa estadísticamente significativa de CcIKB entre 2 y 10 hpc, así como una regulación negativa de CcLITAF entre 2 y 4 hpc, seguida en ambos casos por una regulación positiva entre 24 y 33 hpc. . Este trabajo describe el primer esfuerzo transcriptómico para caracterizar la respuesta inmune de C. concholepas y constituye un recurso transcriptómico valioso para esfuerzos futuros para desarrollar herramientas de conservación y acuicultura sostenible para esta especie endémica de caracol marino.
The population of the Chilean endemic marine gastropod Concholepas concholepas locally called “loco” has dramatically decreased in the past 50 years as a result of intense activity of local fisheries and high environmental variability observed along the Chilean coast, including episodes of hypoxia, changes in sea surface temperature, ocean acidification and diseases. In this study, we set out to explore the molecular basis of C. concholepas to cope with biotic stressors such as exposure to the pathogenic bacterium Vibrio anguillarum. Here, 454pyrosequencing was conducted and 61 transcripts related to the immune response in this muricid species were identified. Among these, the expression of six genes (CcNFκβ, CcIκβ, CcLITAF, CcTLR, CcCas8 and CcCath) involved in the regulation of inflammatory, apoptotic and immune processes upon stimuli, were evaluated during the first 33 h post challenge (hpc). The results showed that CcTLR, CcCas8 and CcCath have an initial response at 4 hpc, evidencing an up-regulation from 4 to 24 hpc. Notably, the response of CcNFKB occurred 2 h later with a statistically significant up-regulation at 6 hpc and 10 hpc. Furthermore, the challenge with V. anguillarum induced a statistically significant down-regulation of CcIKB between 2 and 10 hpc as well as a down-regulation of CcLITAF between 2 and 4 hpc followed in both cases by an up-regulation between 24 and 33 hpc. This work describes the first transcriptomic effort to characterize the immune response of C. concholepas and constitutes a valuable transcriptomic resource for future efforts to develop sustainable aquaculture and conservations tools for this endemic marine snail species.
