Stranding and mass mortality in humboldt penguins (Spheniscus humboldti), associated to HPAIV H5N1 outbreak in Chile
Spheniscus humboldti
Aguayo, C, Alegría, R, Araya, H, Atavales, J, Bennett, B, Enciso, N, Johow, M, Muñoz, G, Neira, V, Quezada, B, Ulloa, M
El virus de la influenza aviar altamente patógeno (HPAIV) H5N1 ha causado un brote global que afecta tanto a animales domésticos como salvajes, predominantemente especies aviares. Hasta la fecha, los casos del HPAIV H5 Clade 2.3.4.4b en pingüinos se han notificado exclusivamente en pingüinos africanos. En Chile, el virus fue confirmado en pelícanos en diciembre de 2022 y posteriormente se propagó por todo el país, afectando a varias especies, entre ellas los pingüinos de Humboldt. Este estudio tiene como objetivo proporcionar una descripción general de los incidentes que involucraron a pingüinos de Humboldt varados y fallecidos y establecer una conexión entre estos eventos y el HPAIV H5N1. Se recopilaron datos históricos sobre varamientos entre 2009 y 2023 y se obtuvieron muestras de casos sospechosos en 2023 para confirmar la presencia de HPAIV H5N1. Entre enero y agosto de 2023 se registraron 2.788 casos de pingüinos varados y fallecidos. De ellos, un total de 2.712 pingüinos fallecidos, evidenciando un aumento significativo de la mortalidad a partir de principios de 2023 coincidiendo con la introducción y propagación del HPAIV H5N1 en el país. Treinta y siete eventos fueron categorizados como eventos de mortalidad masiva, con un número de pingüinos fallecidos que varió de 11 a 98. La mayoría de los casos (97 %) se observaron en el norte de Chile. Ciento ochenta y una muestras fueron sometidas al diagnóstico de HPAIV, cuatro de las cuales dieron positivo para HPAIV H5N1. El análisis espacial valida la correlación entre eventos de mortalidad masiva y brotes de HPAIV en Chile. Sin embargo, la tasa limitada de detección de HPAIV H5N1, que puede atribuirse al tipo y la calidad de las muestras, requiere una mayor exploración.
The highly pathogenic Avian Influenza virus (HPAIV) H5N1 has caused a global outbreak affecting both wild and domestic animals, predominantly avian species. To date, cases of the HPAIV H5 Clade 2.3.4.4b in penguins have exclusively been reported in African Penguins. In Chile, the virus was confirmed in pelicans in December 2022 and subsequently spread across the country, affecting several species, including Humboldt penguins. This study aims to provide an overview of the incidents involving stranded and deceased Humboldt penguins and establish a connection between these events and HPAIV H5N1. Historical data about strandings between 2009 and 2023 was collected, and samples from suspected cases in 2023 were obtained to confirm the presence of HPAIV H5N1. Between January and August 2023, 2,788 cases of stranded and deceased penguins were recorded. Out of these, a total of 2,712 penguins deceased, evidencing a significative increase in mortality starting in early 2023 coinciding with the introduction and spreading of HPAIV H5N1 in the country. Thirty-seven events were categorized as mass mortality events, with the number of deceased penguins varying from 11 to 98. Most cases (97 %) were observed in the North of Chile. One hundred and eighty-one specimens were subjected to HPAIV diagnosis, four of which tested positive for HPAIV H5N1. Spatial analysis validates the correlation between mass mortality events and outbreaks of HPAIV in Chile. However, the limited rate of HPAIV H5N1 detection, which can be attributed to the type and quality of the samples, requiring further exploration.
