Salmonella in Coastal Birds in Chile: Detection of a Multidrug-Resistant S. Infantis Bearing the blaCTX-M−65 Gene in a pESI-Like Megaplasmid in Humboldt Penguins.
Spheniscus humboldti
Alvarez, J, Calfucura, P, Crespo-Lopez, O. I, Lurz, P. W. W, Retamal, P., Toledo, V, Torre-Fuentes, L, Ugarte-Ruiz, M, Wiederkehr, C. M
Salmonella enterica es uno de los patógenos transmitidos por alimentos más importantes en todo el mundo, y la aparición de clones de resistencia a múltiples fármacos (MDR) puede agravar su importancia para la salud pública. Las especies de vida silvestre pueden actuar como reservorios de estos clones, pero su papel no se comprende bien. En este estudio, se analizaron muestras fecales de aves playeras, con especial atención al pingüino de Humboldt (Spheniscus humboldti), en peligro de extinción, recolectadas en cinco sitios del centro de Chile con diferentes niveles de presión antropogénica para caracterizar los serovares de S. enterica resistentes a los antimicrobianos. En general, se aisló Salmonella en 22 de las 595 muestras (3,7%), con una positividad que oscilaba entre el 1,6% y el 9,5%, según el sitio de muestreo. Cuatro de los aislados de Salmonella se recuperaron de muestras de pingüinos de Humboldt (1,4% de muestras positivas en esta especie). Se identificaron los serovares Infantis (nueve aislados), Typhimurium (seis), Goldcoast (cuatro) y Enteritidis, Agona y Give (un aislado cada uno). Los niveles de resistencia fueron más altos para el sulfametoxazol (13/21 aislados con un fenotipo no salvaje), ciprofloxacino, tetraciclina y trimetoprima (11/21 cada uno). La secuenciación del genoma completo realizada en ocho cepas de S. Infantis reveló que siete portaban el replicón del plásmido IncFIB (pN55391), lo que indica la presencia del megaplásmido similar a pESI, que alberga determinantes de resistencia a múltiples clases de antimicrobianos, así como a metales pesados, biocidas y virulencia. -genes relacionados. Además, cinco aislados de S. Infantis que mostraron un fenotipo BLEE portaban el gen blaCTX-M-65, tres de los cuales se detectaron en las heces del pingüino de Humboldt. El hallazgo de un clon emergente internacional de S. Infantis en vida silvestre protegida es motivo de preocupación para los especialistas ambientales, animales y de salud pública, que apoyan iniciativas para una vigilancia activa de los rasgos de resistencia y virulencia en la vida silvestre expuesta a áreas antropogénicas.
Salmonella enterica is one of the most important foodborne pathogens worldwide, and the emergence of multidrug resistance (MDR) clones can aggravate its public health importance. Wildlife species may act as reservoirs of these clones, but their role is not well understood. In this study, faecal samples from shorebirds, with a focus on the endangered Humboldt penguin (Spheniscus humboldti), collected from five sites in central Chile with different levels of anthropogenic pressure were analysed to characterize antimicrobial resistant S. enterica serovars. Overall, Salmonella was isolated from 22 of the 595 samples (3.7%), with positivity ranging between 1.6% and 9.5%, depending on the sampling site. Four of the Salmonella isolates were retrieved from Humboldt penguin samples (1.4% positive samples in this species). Serovars Infantis (nine isolates), Typhimurium (six), Goldcoast (four), and Enteritidis, Agona, and Give (one isolate each) were identified. Resistance levels were the highest for sulphamethoxazole (13/21 isolates with a non-wild-type phenotype), ciprofloxacin, tetracycline, and trimethoprim (11/21 each). Whole-genome sequencing performed on eight S. Infantis strains revealed that seven carried the plasmid replicon IncFIB (pN55391), indicating the presence of the pESI-like megaplasmid, harbouring resistance determinants to multiple antimicrobial classes as well as heavy metal, biocides, and virulence-related genes. Furthermore, five S. Infantis isolates that showed an ESBL phenotype carried the blaCTX-M−65 gene, three of which were detected in Humboldt penguin faeces. The finding of an international emerging S. Infantis clone in protected wildlife is of concern to environmental, animal, and public health specialists, supporting initiatives for an active surveillance of resistance and virulence traits in wildlife exposed to anthropogenic areas.
