Molecular analysis in chilean commercial gastropods based on 16S rNA, COI and ITS1-5.8S rDNA-ITS2 sequences.
Concholepas concholepas
Aguilera-Muñoz, F, Gallardo-Escárate, C., Lafarga-De la Cruz, F
https://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-65382009000100003
Los moluscos gasterópodos son parte de los principales recursos marinos cultivados y comercializados en Chile. Existen especies nativas chilenas como el loco (Concholepas concholepas), el local (Thais chocolata), el caracol trumulco (Chorus giganteus), la lapa (Fissurella spp.), el caracol tegula (Tegula atra) así como especies exóticas como el abulón rojo ( Haliotis rufescens) y abulón japonés (Haliotis discus hannai). A pesar de su importancia como recursos marinos, los estudios de genética molecular que establezcan relaciones filogenéticas y estimen parámetros genéticos poblacionales son escasos. El objetivo de este estudio es establecer un enfoque molecular entre las principales especies de gasterópodos comerciales en Chile. Los genes mitocondriales 16S rRNA y COI, y la región ribosómica nuclear ITS1-5.8SrDNA-ITS2 se amplificaron mediante PCR y secuenciación. Se utilizó el análisis de alineación para determinar relaciones sistemáticas a nivel específico para las especies estudiadas. Los resultados revelaron que 7 especies se agrupan en 4 familias genéticamente distintas (Haliotidae, Trochidae, Muricidae y Fissurellidae). En comparación con la secuenciación COI, la secuenciación de 16S rRNA e ITS1-5.8SrDNA-ITS2 fue relativamente más conservada con un porcentaje de divergencia para 16S rDNA e ITSl-5.8SrDNA-ITS2 de 1,2% y 1,8%, respectivamente, en contraste con el valor del 10%. obtenido para COI en abulón.
Gastropod mollusks are part of the principal marine resources cultivated and commercialized in Chile. There are native Chilean species such as loco (Concholepas concholepas), locate (Thais chocolata), trumulco snail (Chorus giganteus), keyhole limpets (Fissurella spp.), tegula snail (Tegula atra) as well as exotic species such as red abalone (Haliotis rufescens) and Japanese abalone (Haliotis discus hannai). Despite their importance as marine resources, molecular genetic studies establishing phylogenetic relationships and estimating population genetic parameters are scarce. The aim of this study is to establish a molecular approach among the main commercial gastropod species in Chile. The mitochondrial genes 16S rRNA and COI, and the nuclear ribosomal region ITSl-5.8SrDNA-ITS2 were amplified by PCR and sequencing. Alignment analysis was used to determine systematic relationships at the specific level for the species studied. The results revealed that 7 species are grouped in 4 genetically distinct families (Haliotidae, Trochidae, Muricidae and Fissurellidae). In comparison with COI sequencing, 16S rRNA and ITSl-5.8SrDNA-ITS2 sequencing were relatively more conserved with a divergence percentage for 16S rDNA and ITSl-5.8SrDNA-ITS2 of 1.2% and 1.8%, respectively, contrasting with the value of 10% obtained for COI in abalone.
